Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zyg11bQ3UFS0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms