Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm16211-201ENSMUST00000147722 1620 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms