Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ssbp4Q3U4B1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms