Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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