Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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