Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms