Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
InipQ3TXT3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms