Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms