Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pnpla6Q3TRM4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pnpla6Q3TRM4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pnpla6Q3TRM4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pnpla6Q3TRM4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pnpla6Q3TRM4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnpla6Q3TRM4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms