Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms