Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc13Q3TIR1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Trappc13Q3TIR1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Trappc13Q3TIR1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc13Q3TIR1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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