Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hddc2Q3SXD3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms