Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
V1rd19Q3KNP5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms