Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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