Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam178bQ24JP3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam178bQ24JP3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms