Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd3Q14AI6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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