Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms