Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms