Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms