Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms