Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms