Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms