Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms