Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms