Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms