Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms