Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cntn3Q07409 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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