Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms