Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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