Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms