Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms