Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms