Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms