Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Top2aQ01320 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms