Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms