Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms