Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gabpb1Q00420 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gabpb1Q00420 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gabpb1Q00420 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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