Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nbr1P97432 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms