Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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