Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx3P81067 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms