Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms