Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chl1P70232 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chl1P70232 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms