Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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