Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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UbdP63072 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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UbdP63072 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbdP63072 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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UbdP63072 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbdP63072 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms