Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms