Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps18P62270 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms