Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ube2d1P61080 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms