Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ppfia3P60469 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms