Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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