Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpa1P57784 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms